從本質(zhì)意義上說，《中華人民共和國仲裁法》所規(guī)定的仲裁制度與《中華人民共和國勞動(dòng)爭(zhēng)議調(diào)解仲裁法》規(guī)定的勞動(dòng)爭(zhēng)議“仲裁”制度是截然不同的。《仲裁法》所規(guī)定的仲裁制度，是我國按照國際通行慣例在民商事領(lǐng)域內(nèi)統(tǒng)一建立的法律制度；而現(xiàn)行的勞動(dòng)爭(zhēng)議“仲裁”制度則是國家針對(duì)勞動(dòng)爭(zhēng)議的特殊性，在該領(lǐng)域設(shè)立的處理勞動(dòng)爭(zhēng)議的專門制度，其與有關(guān)國際公約所稱的仲裁并無任何聯(lián)系。《中華人民共和國仲裁法》第七十七條特別規(guī)定勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁另行規(guī)定，不適用仲裁法。歸納起來，兩者主要有以下區(qū)別：
1.在機(jī)構(gòu)設(shè)置方面，仲裁委員會(huì)不按行政區(qū)劃層層設(shè)立，可以在直轄市和省、自治區(qū)人民政府所在地的市設(shè)立，也可以根據(jù)需要在其他設(shè)區(qū)的市設(shè)立；而勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁委員會(huì)是按行政區(qū)劃分別在縣、市和市轄區(qū)等設(shè)立的處理勞動(dòng)爭(zhēng)議的特別機(jī)構(gòu)，其常設(shè)辦事機(jī)構(gòu)設(shè)于各同級(jí)勞動(dòng)行政主管部門內(nèi)。
2.在受案范圍方面，仲裁涵蓋民事、經(jīng)濟(jì)的絕大多數(shù)領(lǐng)域，包括各類合同糾紛和其他財(cái)產(chǎn)權(quán)益糾紛；而勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁僅限于勞動(dòng)爭(zhēng)議。
3.在管轄方式方面，仲裁實(shí)行協(xié)議管轄，當(dāng)事人可自主選擇訴訟或者仲裁，也可自主選定仲裁委員會(huì)；而勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁實(shí)行地域管轄和級(jí)別管轄，當(dāng)事人之間發(fā)生勞動(dòng)爭(zhēng)議后不得直接向人民法院起訴，而必須先申請(qǐng)勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁且當(dāng)事人之間無需訂有仲裁協(xié)議。
4.在裁決效力方面，仲裁實(shí)行一裁終局制度，裁決一經(jīng)作出，即發(fā)生法律效力；而勞動(dòng)爭(zhēng)議仲裁裁決是非終局性的，當(dāng)事人不服還可以向人民法院起訴。